| Name | Location | Comments | Picture |
| Botanischer Garten Aachen | Aachen | | |
| Botanischer Garten Adorf | Adorf/Vogtl. | | |
| Botanischer Garten Schellerhau | Altenberg | | |
| Botanischer Erlebnisgarten Altenburg | Altenburg | | |
| Natural History Museum, Aschaffenburg | Aschaffenburg | | |
| Botanischer Garten Augsburg | Augsburg | | |
| Kurpark Bad Bellingen | Bad Bellingen | | |
| WeltWald Harz | Bad Grund | | |
| Botanischer Garten in Bad Langensalza | Bad Langensalza | | |
| Pflanzengarten Bad Schandau | Bad Schandau | | |
| Lichtentaler Allee | Baden-Baden | | |
| Staatliche Baderverwaltung Badenweiler | Badenweiler | | |
| Ökologisch-Botanischer Garten der Universität Bayreuth | Bayreuth | | |
| Botanical Garden in Berlin | Berlin | | |
| Späth-Arboretum | Berlin | | |
| Botanischer Garten Bielefeld | Bielefeld | | |
| Botanischer Garten der Ruhr-Universität Bochum | Bochum | Founded in 1968. |  |
| Arboretum Park Härle | Bonn | | |
| Botanische Gärten der Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn | Bonn | | |
| Botanischer Garten der Technischen Universität Braunschweig | Braunschweig | | |
| Rhododendron-Park Bremen | Bremen | | |
| Botanischer Garten Chemnitz | Chemnitz | | |
| Arktisch-Alpiner Garten der Walter-Meusel-Stiftung | Chemnitz | | |
| Botanischer Garten der TU Darmstadt | Darmstadt | | |
| Botanischer Garten Rombergpark | Dortmund | With 68 hectares the largest botanical garden in Germany. | |
| Botanischer Garten der Technischen Universität Dresden | Dresden | | |
| Botanischer Garten Duisburg-Hamborn | Duisburg | | |
| Botanischer Garten Kaiserberg | Duisburg | | |
| Botanischer Garten Düsseldorf | Düsseldorf | | |
| Forstbotanischer Garten Eberswalde | Eberswalde | | |
| Hortus Eystettensis | Eichstätt | | |
| Arboretum Ellerhoop-Thiensen | Ellerhoop | | |
| Botanischer Garten Erlangen | Erlangen | | |
| Arboretum Main-Taunus | Eschborn | | |
| Botanischer Garten Grugapark | Essen | | |
| Botanischer Garten der Universität Duisburg-Essen | Essen | | |
| Palmengarten | Frankfurt am Main | | |
| Botanischer Garten der Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt am Main | Frankfurt am Main | | |
| Arboretum Freiburg-Günterstal | Freiburg im Breisgau | | |
| Freiburg Botanic Garden | Freiburg im Breisgau | | |
| Sichtungsgarten Weihenstephan | Freising | | |
| Alpengarten auf dem Schachen | Garmisch-Partenkirchen | | |
| Botanischer Garten Gera | Gera | | |
| Akademischer Forstgarten Gießen | Gießen | | |
| Botanischer Garten Gießen | Gießen | | |
| Alter Botanischer Garten der Universität Göttingen | Göttingen | | |
| Neuer Botanischer Garten der Universität Göttingen | Göttingen | | |
| Forstbotanischer Garten und Pflanzengeographisches Arboretum der Universität Göttingen | Göttingen | | |
| Forstlicher Versuchsgarten Grafrath | Grafrath | | |
| Greifswald Botanic Garden | Greifswald | | |
| Botanischer Garten für Arznei- und Gewürzpflanzen Oberholz | Großpösna | | |
| Stadtpark und Botanischer Garten Gütersloh | Gütersloh | | |
| Botanische Garten der Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg | Halle, Saxony-Anhalt | | |
| Alter Botanischer Garten Hamburg | Hamburg | | |
| Arboretum Lohbrügge | Hamburg | | |
| Botanischer Garten Hamburg (Biozentrum Klein Flottbek und Botanischer Garten) | Hamburg | | |
| Botanischer Sondergarten Wandsbek | Hamburg | | |
| Herrenhäuser Gärten Hannover | Hannover | | |
| Botanischer Schulgarten Burg | Hannover | | |
| Heil- und Giftpflanzengarten der Tierärztlichen Hochschule Hannover | Hannover | | |
| Forstbotanischer Garten in Hannoversch Münden | Hannoversch Münden | | |
| Botanischer Garten der Universität Heidelberg | Heidelberg | | |
| Botanischer Garten der Stadt Hof | Hof | | |
| Botanischer Garten des Deutschen Medizinhistorischen Museums | Ingolstadt | | |
| Botanischer Garten Jena | Jena | | |
| Botanischer Garten der Universität Karlsruhe | Karlsruhe | | |
| Botanischer Garten Karlsruhe | Karlsruhe | | |
| Botanischer Garten Kassel | Kassel | | |
| Gewächshaus für tropische Nutzpflanzen | Kassel | | |
| Alter Botanischer Garten Kiel | Kiel | | |
| Botanischer Garten der Christian-Albrechts-Universität zu Kiel | Kiel | | |
| Flora und Botanischer Garten Köln | Köln | | |
| Forstbotanischer Garten Köln | Köln | | |
| Botanischer Garten der Universität Konstanz | Konstanz | | |
| Botanischer Garten Krefeld | Krefeld | | |
| Botanischer Garten der Universität Leipzig | Leipzig | | |
| Botanischer Garten für Arznei- und Gewürzpflanzen Oberholz | | | |
| Arboretum Lehmkuhlen | Lehmkuhlen | | |
| Arktisch-Alpiner Pflanzengarten und Alpine Staudengärtnerei | Leisnig | | |
| Gruson-Gewächshäuser | Magdeburg | | |
| Blumeninsel Mainau | Mainau | | |
| Botanischer Garten der Johannes Gutenberg-Universität Mainz | Mainz | | |
| Stadtpark Mannheim | Mannheim | | |
| Alter Botanischer Garten Marburg | Marburg | | |
| Neuer Botanischer Garten Marburg | Marburg | | |
| Bunter Garten | Mönchengladbach | | |
| Botanischer Garten Verein "Hochschulstandort Mühlhausen" | Mühlhausen | | |
| Botanischer Garten München-Nymphenburg | München | | |
| Botanische Staatssammlung München | München | | |
| Botanischer Garten Münster | Münster (Westfalen) | | |
| Sequoiafarm Kaldenkirchen | Nettetal | | |
| Botanischer Garten der Nationalpark Bayerischer Wald | Neuschönau | | |
| Botanischer Garten der Stadt Neuss | Neuss | | |
| Rennsteiggarten Oberhof | Oberhof | | |
| Botanischer Garten der Carl von Ossietzky-Universität Oldenburg | Oldenburg | | |
| Botanischer Garten der Universität Osnabrück | Osnabrück | | |
| Alpengarten Pforzheim | Pforzheim | | |
| Botanischer Garten Potsdam | Potsdam | | |
| Biosphäre Potsdam | Potsdam | | |
| Botanischer Garten der Universität Regensburg | Regensburg | | |
| Herzogspark | Regensburg | | |
| Botanischer Garten Universität Rostock | Rostock | | |
| Botanischer Garten der Universität des Saarlandes | Saarbrücken | closed down | |
| Rosarium Sangerhausen | Sangerhausen | | |
| Botanischer Garten Solingen | Solingen | | |
| Arboretum Habichtsborn | Staufenberg | | |
| Wilhelma | Stuttgart | | |
| Hohenheim Gardens | Stuttgart | | |
| Lehmann-Garten | Templin | | |
| Forstbotanischer Garten Tharandt | Tharandt | | |
| Alter Botanischer Garten Tübingen | Tübingen | | |
| Botanischer Garten der Universität Tübingen | Tübingen | | |
| Botanischer Garten der Universität Ulm | Ulm | | |
| Usedoms Botanischer Garten Mellenthin | Usedom | | |
| Exotenwald Weinheim | Weinheim | | |
| Schau- und Sichtungsgarten Hermannshof | | | |
| Brockengarten | Wernigerode | | |
| Botanischer Garten der Stadt Wilhelmshaven | Wilhelmshaven | | |
| Gewächshaus für tropische Nutzpflanzen | Witzenhausen | | |
| Dessau-Wörlitz Garden Realm | Wörlitz | | |
| Arboretum Burgholz | Wuppertal | | |
| Botanischer Garten Wuppertal | Wuppertal | | |
| Botanischer Garten der Universität Würzburg | Würzburg | | |
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